在诸多与癌症干系的基因里，TP53是当前研究得最为透辟的基因之一，以抑癌劝化而驰名。它就像一个“标兵”一样监控细胞内的无比勾当，感知细胞的压力或损伤，并响应地制止无比细胞割裂或令无比细胞“自刎”，从而阻止受损细胞繁殖。而TP53编码的p53卵白具有抑癌劝化，被誉为“人类基因组的捍卫者”。
当TP53如许须要的脚色孕育发生渐变时，除了一个需求的细胞安然机制失守外，还会促退癌症的发生发火。明确其突变的历程对于阻止癌症的发生发火以及开荒更有用的医治威力都有着极为重要的含意。
昨天，美国贝勒医学院揭橥在《Cell Reports》杂志上的一项研讨，暗示了TP53基因是如何孕育发生突变的，以及这些渐变对病例前景诊断的劝化。
DOI:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.07.001
超大样板量
贝勒医学院的份子病毒学及微生物学教授Larry Donehower率领的研讨小组钻研了来自癌症基因图谱（TCGA）报告的32种不同癌症的10,225名患者样本，并将它们与巴黎索邦大学的份子生物学教授Thierry Soussi过去三十多年征集、构建的渐变数据库中的另外80,000个渐变进行对比综合。
钻研小组缔造，在全数被研究的癌症类型中，保存率比较低的癌症患者中TP53突转变为频仍。但钻研人员也找到了一种更精确料想预后的法子。
Donehower传授说：“我们在渐变的TP53肿瘤中创造了四个上调基因，它们的表述与患者的预后有关。若是这四种基因的诠释程度很高，那么患者预后有或者更差；相似，假定患者的这些基因表明非常低，患者就有或者活得更长，预后也更好。经过这些基因的评释能够让大夫更好的明了患者的将来，而不单仅是参照患者的TP53是否渐变。”
91%的缺乏模式
在染色体程度上，研究小组创造TP53基因散失有一个显着的内容。超越91%的TP53突变型癌症表现出第二等位基因渐变丢失，该种损失是由于渐变、染色体缺乏或基因复制作成的。无非，基因复制的发作率比畴昔认为的要高得多。
钻研还表明，TP53渐变与基因组不摇动性亲热相干，提示正常蛋白在监测染色体残破性方面的感导。在大大都TP53突变型肿瘤中，癌基因扩增增加以及抑癌基因深度不够。TP53突变的肿瘤在RNA、miRNA与蛋白诠释模式上与非渐变的肿瘤差距，突变的TP53肿瘤表现为细胞周期搁浅基因和卵白的抒发加强。此外，渐变的TP53RNA告白特色与11种癌症类型的存活率消沉有显著相干性。因此，TP53突变对肿瘤细胞基因组构造、标明和病例前景存在深远的影响。
结语
尽管关于TP53的研究有许多，但这是第一次运用五种不同的数据搜集方法来检测云云少许的肿瘤和癌症类型。Donehower展示，这项研究的规模使他的团队能够寄望到大样本带来的模式与关系性，而在较小的样板中能够其实不明显。
“大多半关于TP53的研讨都汇合在一种癌症类型上。窥察32种差距的癌症类型，你会发明无论哪类癌症类型，某些内容都是成立的。”
该研究的一块儿作者、贝勒医学院莱斯特和苏·史密斯乳腺中心癌症基因组学主任David Wheeler博士说：“这项研讨的事实或者为因该基因缺失而受影响的癌症医治封锁新大门。由于TP53是癌症防备中重要的‘哨兵’之一，咱们对该基因熟习得越多，就越能理解癌症的根底生物学，也能拓荒更好的医治方式。”
参考质料：
[1] p53mutations in 10,000 cancer patients shed new light on gene's function[2] IntegratedAnalysis of TP53 Gene and Pathway Alterations in The Cancer Genome Atlas
原标题问题：10225例癌症患者大样本揭示：抑癌基因TP53突变影响癌症治疗与预后
