免疫细碎作为人体的健康护卫队会珍爱我们免受外来病原体像是细菌可以病毒的滋扰，然而只需很少的稀有免疫细胞能够“辨认”癌症。由于癌症一般是由自身细胞进行更动而来，奸诈的癌细胞会给免疫细胞发出“我是本身人，别杀戮我”的信号获胜逃过免疫零碎的搜查。
刻期，澳大利亚的科学家垦荒出一种用于辨认癌症孕育发生中罕见免疫细胞的妙技。科学家使用该武艺初次跟踪了免疫细胞在肿瘤机关内的进化情况，示意了若何更好地武装免疫体系以靶向癌症。该研究发表在新一期的《Nature Co妹妹unications》杂志上 。
DOI：10.1038 / s41467-019-11049-4
“看到”癌症的罕见免疫细胞
免疫琐细的“哼哈二将”（T细胞与B细胞）在细胞外貌上表达一致的受体，当这些细胞被抗原刺激后，就会进行豆剖复制（或克隆）扩增。免疫细胞受体可作为稀罕的“克隆条形码”提供无关抗原特同性的相关新闻。
为了找寻这些免疫细胞，先前的办法是在单细胞程度上读取编码T细胞与B细胞受体的长序列RNA。但是，现有技艺不能一次性分选出肿瘤中具有的数千个细胞。必须对数千个细胞进行分类，才能找到那些克隆细胞，而这些克隆细胞可能只占肿瘤中全部免疫细胞的一小局部。别的，虽然长序列读取技艺的进行可以用意基因组测序中序列读取长度的问题，但这种方式一般过错率更高，测序深度更低。
为了攻陷这些艰难，研讨职员集四种分歧的基因组测序武艺（Oxford Nanopore Technologies，10X Genomics，Illumina与CaptureSeq）于一体开收回了“RAGE-seq”妙技。
他们起首开收回一种从单细胞中富集RNA的门径，靶向编码免疫细胞受体的RNA。今后，开荒了相应的总计器械，因而可以对免疫细胞受体的全长序列进行准确测序。
图片本源：Martin Smith
RAGE-seq的任务事理近似于“条形码追踪器”
RAGE-seq能够扫描数千个细胞中的免疫细胞受体，以供给布局样本中免疫细胞之间关连的粗略“快照”，并果决哪些免疫细胞可能对癌症无效。由于该武艺涣散特定淋巴细胞群的门径与激进门径一致，是以它可用于追溯低丰度淋巴细胞群。
Garvan研讨所履行主任Chris Goodnow博士表示：“这种法子为咱们提供了迄今为止关于免疫细胞在人体中如何勾当的最具体的视图。免疫细胞在疾病的进行中扮演着需求的脚色。这类方式显示出了远大的潜力，可以副手咱们将癌症医治本色化。”
三阳性乳腺癌力证RAGE-seq
为了验证该技术手段，研究职员对三阴性乳腺癌患者的肿瘤与淋巴结的细胞样板进行了RAGE-Seq测试，以追踪扩增的淋巴细胞克隆的转录组图谱，计议免疫零碎细胞若何应对癌症。该团队肯定了两种布局中存在许多相关细胞，并提示了患者肿瘤内免疫反馈的特定遗传特征。
RAGE-Seq的一个紧要使用是能够跟踪机关中克隆相关的T细胞或B细胞，以获取对免疫反应进化的琐屑化洞察。它能够剖析肿瘤及其引流淋逢迎中的淋巴细胞、抗原呈递的要是位点以及肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的源头。
这种辨认肿瘤组织中希有免疫琐细细胞的才干可以接济率领特性化治疗。制药公司能经由RAGE-seq供应的打点方案更好地明白免疫细碎对癌症的反馈。Goodnow教授展示：“我们盼愿RAGE-seq将在临床试验中实施，供应关键信息，副手荫蔽的癌症医治更快地找到契合的患者。”
该团队当时正将该技术使用于黑色素瘤患者的样板，以体会为什么遭受免疫治疗的患者中有一半的反应较差。研讨职员认为，该方法也可用于更好地理解自身免疫性疾病与炎症性疾病。
参考资料：
[1] A genomic barcode tracker for i妹妹une cells
[2] Anticancer I妹妹une Cells Identified Using Antigen Receptor Barcode Tracker
原问题：Nature子刊：战斗的军号已吹响！“条形码”追踪器鉴定抗癌免疫细胞
